古蹟因老樹生趣盎然，老樹因古蹟歷久彌新，走訪歷史古蹟，向來少不了有生命、有故事的樹木，為了守護古蹟區裡長伴市民成長的重要樹木，臺南市政府文化局特於102年7月25日舉辦一場「古蹟『森』呼吸—臺南市古蹟老樹維護管理座談會」，與會學者皆強調應落實「預防勝於治療」的觀念於古蹟區樹木管理實務中。為利提供樹木異常診斷參照值，日常管理應重視樹木生長概況、異常情形定期健康檢查與疾病防治之紀錄；同時，為有效預防及以正確方式抑制病情蔓延，應定期辦理教育訓練課程或定期交流資訊之方式，加強管理人員對樹木異常之警覺性與鑑別力。
103年1月份至103年5月份臺南市政府文化局與國立臺南大學生態科學與技術學系合作進行「臺南市示範古蹟區重要樹木調查產學合作計畫」，委請植物分類實驗室主持人謝宗欣教授擔任本次計畫主持人，並選擇文化局經營管理之安平古堡、億載金城、赤崁樓、延平郡王祠及安平樹屋作為樹木健康管理之示範古蹟區，103年9月份增加五妃廟。另針對胸高直徑(DBH, diameter of breast height)20公分以上之植物，或胸高直徑雖未超過20公分，但具有文化代表性、人文歷史代表性、地理代表性、生態代表性和珍稀樹種之植物進行調查研究，稱之為「重要樹木」。
